闸北区疾病预防控制中心沿革于闸北区卫生防疫站（成立于1950年）卫生体制改革后重组，成立于1999年12月，是政府负责的实施区级疾病防控与公共卫生技术管理和服务的公益事业单位。通过对疾病和伤害的防控，创造健康环境，维护社会稳定，保障生命安全，促进人民健康。
    中心下设传染病防制科、免疫预防科、病媒消毒科、艾滋病性病防制科、慢性病预防科、环境职业医学科、健康教育科、预防性体检科、理化实验室、微生物实验室、综合办公室、后勤保障科、质量管理科等十三个科室。中心现有职工101人，其中卫生技术人员76人，大学以上学历24人，高级职称2人。
    中心以区域疾病预防控制为重点，加强有关策略和措施研究，开展各项公共卫生业务管理和健康教育促进工作，在防病、应急、公共卫生信息能力建设等方面发挥积极作用。承担“闸北区居民伤害流行特征和疾病负担的研究”、“环境内分泌干扰物邻苯二甲酸酯类在人体生物样品中含量的研究”等6项市疾控立项课题获，“闸北区大气污染与COPD死亡率关系的研究”、“闸北区结核病防治管理新模式的实施研究”等13项区科委立项课题研究工作。
    中心1999年以来连续4届被评为上海市卫生系统文明单位，先后荣获上海市卫生系统抗击非典先进集体，卫生部、教育部联合授予“全国学生常见病综合防治工作先进集体”的荣誉称号，中心党支部被闸北区委授予“先进基层党组织标兵”的荣誉称号。